Las Ayudantías Militares de Marina eran organismos de la Administración del Estado que, bajo el mando de las Comandancias Militares de Marina de la provincia, gestionaban los asuntos militares, de marina mercante y de pesca en un distrito marítimo.

El mando de las Ayudantías lo ejercían oficiales del Cuerpo General de la Armada o de la Reserva Naval Activa, con el nombre de ayudantes militares de marina.