El Decreto de 10 de julio de 1931 reorganiza la defensa naval y establece la existencia, en el litoral, de Bases Navales principales (Ferrol, Cádiz y Cartagena) y de aprovisionamiento ( Ríos y Mahón).

La Ley de 12 de enero de 1932, que crea la Subsecretaría de la Marina Civil, suprime las Comandancias y Ayudantías de Marina y las substituye, en su artículo 11, por Delegaciones Marítimas, de carácter civil.

El final de la Guerra Civil, el 1 de abril de 1939, supuso el final de la República Española.